在第一话中出现的绫波丽当然是用她的备份身体复活的，一般称为“第二个”。按照网上流行的说法，因驾驶零号机暴走（失控）而身收重伤、还躺在病床上、手上打着石膏的她被碇元度用来逼碇真治驾驶初号机。只因为碇元度的一声命令，她就挣扎着从病床上爬了起来，由此可见她对碇元度的绝对服从已经到了机器人的地步。 

在以后的各话中，可以看到绫波丽的性格十分冰冷，不仅面无表情，连说话也是冰冷得另人感到莫名的恐惧。她一个人住在很破旧的公寓楼里，房间简直象监狱一样简陋：床、桌子、灯、装满染血绷带的垃圾桶。。。。。。在学校里她没有一个朋友，从不与人交往。据一些资料说，她相信自己是为了驾驶EVA和服从碇元度而生，除此之外她便不去管其他的事情。在零号机的启动实验中发生意外，弹出的插入栓因在墙壁上摩擦而产生高温，见到此景的碇元度不顾一切地用手拉开滚烫的舱门，眼镜也因此破碎(这个眼镜成了绫波丽的宝贝，在第五话中，真治就是因为在她家里不小心戴上了，差点被愤怒的绫波丽吓死，结果。。。）。了解此事的碇真治感到父亲对绫波丽比对自己不知好了多少倍，到后来见到在冷冻中的零号机旁碇元度与绫波丽谈笑风声，更让他觉得被父亲抛弃了（这一幕是绫波丽在TV版中第一次露出笑容）。 

在消灭第五使徒的战斗中，绫波丽驾驶零号机用航天飞机底盘制成的盾牌挡住了使徒的加粒子炮，自己也差点死于高温（零号机的外壳都融化了）。用阳电子枪击毁使徒的碇真治也不顾高温打开插入栓舱门，看到的是仍然活着的绫波丽，他再也控制不住，流下了激动的泪水。见到此景，本来毫无感情的绫波丽终于说道：“真系对吾住，我宜家吾知道做乜表情。”（我第一次看TV版是听的粤语）而真治说：“你只要笑就得了。”面对真治，绫波丽竟然在脑海中浮现了碇元度然后才露出笑容（真让我不爽）。不管怎样，感谢这家伙，我们终于看到了绫波丽的第二次微笑。在TV版中画得不怎么好，而在剧场版《死亡与新生》中画得实在太美了！我有次在南宁聊天室和网友“行而上学”交流，都说这是绫波丽对真治产生感情的开始（也是悲剧的开始）。 


绫波丽露出了笑容（漫画） 
（剧场版） 

等到明日香出场，绫波丽的戏被抢了不少。到了第十五话，在学校劳动时，碇真治看到绫波丽扭抹布时的姿势忽然想到了什么，后来在NERV的电梯中真治对她说这个姿势很象母亲，绫波丽的脸顿时泛起红晕（好可爱）。看来真治的话唤起了碇唯残存的记忆。到第十六话时碇真治的初号机被使徒吞没，葛城叫明日香和绫波丽撤退，只有她说道“吾可以，真治仲系下边。”，当明日香嘲笑真治的失败时绫波一反常态怒斥她。看来绫波丽已从一个不懂感情为何物的人造人逐渐成为拥有人类最真挚感情的少女。到第十七话，真治和铃原东治（叁号机驾驶员）来到她家中，看到她不在，真治便自己动手收拾房间。回来见到此景的绫波顿时又涨红了脸（还说了声“谢谢”。等到真治他们走后，绫波丽独自一人在床上陷入了深深的思考。她在这时也许已经知道自己对真治的感情了。“点解会艮样呢？我对渠（指碇元度）仲未讲过多谢”。 

到第23话，第二个绫波丽的生命走到了终点。遭到第十六使徒的攻击。零号机被侵蚀，生出了树根状的突起，接着传染到驾驶员本身。同时，使徒也试着与她交流（一般认为在丽的心灵对话中出现的另一个她是第十六使徒）。丽终于知道了她心中的寂寞，其实她一直都害怕寂寞。泪水一滴滴的掉下来（在充满LCL的驾驶舱里怎么会成一滴滴的？）。。。丽会流泪，说明她渐渐有了人类的感情。看到零号机出了意外，碇元度下令刚经过觉醒暴走的初号机营救。谁知初号机被使徒逼的连连败退，差点又被侵蚀。看到向初号机扑去的第十六使徒，绫波丽忽然说道：“这就是我的心？想和真治君在一起？”关于这句话，有很多不同的理解，但不管怎么说，她终于知道自己的感情，为了救初号机，绫波丽打开零号机的自爆开关，她选择了以死来救真治。拉开关的一刹那，她竟然看见的是碇元度？！（和她第一次露出笑容时看见的相同，真是气死我了。。。）随着眼泪夺眶而出，第二个绫波丽与零号机、使徒、第三新东京市化成了巨大的火球。。。 

第二个绫波丽的死，台湾网站《幕末的镇魂歌》中的解释我觉得最为合理。据该站所写，绫波丽相信自己是为碇元度而生，但是和真治不断增长的感情违背了她活下去的信念。她不愿背离这个信念，但是又无法割舍与真治的感情，只好选择一死，以让另外的一个她（绫波丽有很多的备用身体）舍弃对碇元度的服从，和真治继续这段悲戚的感情。该站还引用了《福音战士》漫画中的话： 

无法告诉你的言语 
无法传达给你的思念 
就让我一个人全带走吧 
希望下一个我 
可以只喜欢上你一个人。。。 

这句话（也许是诗）就象是绫波丽的遗言。。。该站站长说道：“写到这里，不禁潸然泪下”。而jedi在看到这里，一想到绫波临死前的泪水，不禁鼻子也酸了起来。一次和网友行而上学在南宁聊天室谈起绫波丽，我给他讲起这首诗，他立即用了一个聊天命令：“形而上学越想越伤心，终于忍不住伏在jedi的肩膀上大哭起来。。。” 

这一话也揭露了绫波丽的身世。通过加持，葛城获得了进入Terminal Dogmal的密码，在那里她见到了也想进去的赤木律子和碇真治（应该是赤木律子故意带来的，想让真治对绫波死心）。在那里，葛城和真治见到了令他们万分惊诧的场面：一个巨大的水槽中浸泡着无数的绫波丽。赤木律子这时冷冷地说道：“这些只是绫波丽的身体，是没有灵魂的，只是容器，灵魂的容器。。。”在剧场版中她还说：“人类捡到了神，欢欢喜喜地想把它据为己有，结果遭到了惩罚（指人类在南极捡到亚当，引起爆炸）。那便是亚当，由神仿制出模仿神的人类，那便是EVA！”讲完这句揭开许多谜的真面目的话后，赤木律子忽然掏出一个控制器，按下按钮，一边说道：“所以我要破坏她，因为我恨她。”顿时，所有在水槽中的绫波丽的身体都支解破碎了。原来她和母亲赤木直子都爱上了碇元度，但是元度在碇唯死后只对她的“化身”绫波丽表露关怀，令她万分妒忌“我和母亲都比不过一个死人